2017年京都大学大学院農学研究科農学専攻博士後期課程修了。博士（農学）。2018年京都大学大学院農学研究科・特定助教，2019年京都大学複合原子力科学研究所・研究員を経て、2021年より京都大学複合原子力科学研究所・助教、2023年より現職。

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研究分野

特定部分に着目する構造解析を目指した区分重水素化タンパク質の調整

酵素を用いたタンパク質ライゲーション

実験と計算の協働により効率的なタンパク質ライゲーションを実現

代表的な論文
Okuda, A.; Shimizu, M.; Inoue, R.; Urade, R.; Sugiyama, M. Efficient Multiple Domain Ligation for Proteins Using Asparaginyl Endopeptidase by Selection of Appropriate Ligation Sites Based on Steric Hindrance. Angew. Chem. Int. Ed. 2023, 62, e202214412. DOI: 10.1002/anie.202214412

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機能と相関するドメイン運動を持つマルチドメインタンパク質ER-60

区分重水素化試料を用いてドメイン運動が推定される特定ドメインに着目した構造解析を目指す

代表的な論文
Okuda, A.; Shimizu, M.; Morishima, K.; Inoue, R.; Sato, N.; Urade, R.; Sugiyama, M. Solution structure of multi‑domain protein ER‑60 studied by aggregation‑free SAXS and coarse‑grained‑MD simulation. Sci. Rep 2021, 11, 5655. DOI: 10.1038/s41598-021-85219-0

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連絡先

〒590-0494 大阪府泉南郡熊取町朝代西2
京都大学 複合原子力科学研究所 粒子線物性学研究分野
Mail　okuda.aya.5r@kyoto-u.ac.jp